Když se kapitán Colter Stevens probudí v příměstském vlaku, netuší, kde se tam vzal. Naproti němu sedí Christina, kterou vidí poprvé v životě, ale ona ho očividně dobře zná a oslovuje ho Seane. Colter zjišťuje, že se probudil v těle jiného člověka. Než se stihne z nastalé situace vzpamatovat, je vlak rozmetán silným výbuchem. Vzápětí se objeví v podivném bunkru a přes obrazovku k němu mluví důstojnice Goodwinová a požaduje informace o všem, co právě viděl. Stal se totiž součástí experimentu nazvaného Zdrojový kód, jehož cílem je odhalení útočníka, který má na svědomí výbuch vlaku, v němž se ještě před chvílí nalézal. Seanovu identitu může využívat pouze osm minut, ale Zdrojový kód zvládá poslat Coltera do stejného časového úseku vícekrát. Získává tak více času, situace se mu však může snadno vymknout z rukou…