Certo dia, enquanto viajava de autocarro, Sakurakouji Sakura olha pela janela e vê pessoas a serem queimadas vivas num fogo azul por um rapaz da sua idade que se encontra ileso entre elas. No dia seguinte, ela regressa ao local e não encontra corpos ou qualquer tipo de pistas de um assassínio, apenas de um pequeno incêndio. Ela segue então para a escola onde fica a saber que chegou um novo aluno transferido, Oogami Rei, um rapaz que se parece exactamente com aquele que ela viu anteriormente, e que usa uma única luva preta na mão esquerda. Oogami é um Code Breaker, alguém que "não existe”. Aparentemente ele é um assassino que segue o ditado "olho por olho”, para usar o "mal contra o mal”. Convencida de que matar é errado, Sakurakouji define como objectivo pará-lo e penetrar no seu gelado coração.